تأسس قسم الطب في عام 1970. وكان رئيس القسم في ذلك الوقت الدكتور مصطفى رجب النعمة ، وتألفت هيئة التدريس من العديد من الأكاديميين والأطباء المحليين. كان القسم مسؤولاً عن تدريس الطب الباطني لطلبة البكالوريوس فقط. أما الان يضم القسم الآن 41 عضوًا مؤهلين بأعلى درجة في الطب الباطني والتخصصات الفرعية الطبية الأخرى مثل أمراض القلب والأمراض الجلدية وأمراض الكلى وأمراض الأعصاب والغدد الصماء والأورام وأمراض الدم وأمراض الروماتيزم والطب النفسي. ويشاركون في البرامج التدريبية للبورد العراقي والعربي في الطب الباطني ، والأمراض الجلدية ، والطب النفسي ، والغدد الصماء. كما يشارك أعضاء هيئة التدريس بالقسم بنشاط في تقديم خدمات الرعاية الصحية الطبية في المستشفيات الأربعة الرئيسية في محافظة البصرة. يحتل القسم قسماً مخصصاً في الطابق الثاني من المبنى الجديد لكلية الطب ، مع عدد كافٍ من المكاتب وغرف التدريس والندوات الصغيرة. بالإضافة إلى ذلك ، يستفيد القسم من جميع قاعات المحاضرات المشتركة الموجودة تحت تصرف الكلية.